3 / 15
Ф.Б. Байрамов, В.В. Топоров, Е.Д. Полоскин
72
ISSN 1812-3368. Вестник МГТУ им. Н.Э. Баумана. Сер. Естественные науки. 2017. № 2
синтезируются в несколько этапов, как правило, в одной емкости. При этом
используют реагенты очень высокой степени чистоты, очистка которых осуществ-
ляется с применением важнейших методов высокоэффективной жидкостной хро-
матографии, либо электрофореза в полиакриламидном геле. Несмотря на все эти
достижения, различные постсинтетические обработки, такие как удаление из его
состава различных защитных функциональных групп, непрореагированных реа-
гентов и недостроенных продуктов, не способствуют получению особочистых оли-
гонуклеотидов.
Актуальность.
Синтез высокочистых олигонуклеотидов очень важен как в
научных, так и в технологических целях. Чрезвычайно важны
исследования,
направленные на изучение механизмов структуры и взаимодействия между от-
дельными атомами, молекулами и функциональными группами олигонуклеоти-
дов, а также зависимостей от физико-химических свойств окружающей среды
.
Актуальная проблема — разработка новых высокоэффективных методов иссле-
дования структуры олигонуклеотидов на молекулярном уровне.
Существующие проблемы.
Обычно визуализация и выявление олигонук-
леотидов осуществляются с помощью флуоресцентных красителей, которые
встраиваются между отдельными мононуклеотидами. Основным недостатком
такого метода является то, что увеличение флуоресценции в процессе ПЦР мо-
жет быть связано с накоплением неспецифического продукта. Кроме того, ато-
мы и молекулы красителей вступают в химические реакции с атомами и моле-
кулами олигонуклеотидов. Поэтому для получения корректных результатов о
молекулярной структуре и о механизмах межмолекулярных взаимодействий
необходимы новые методы, не основанные на использовании олигомеров, со-
держащих такие метки.
Эффективным аналитическим методом исследования структуры материалов
на молекулярном уровне является спектроскопия комбинационного (рамановско-
го) рассеяния света. С обнаружением эффекта гигантского поверхностного усиле-
ния [2–4] комбинационного рассеяния (Surface Enhanced Raman Scattering, SERS)
на 6–12 порядков величины в присутствии металлических наноструктур, на кото-
рых адсорбируются органические молекулы, интерес к этому важному явлению
привлекает все более возрастающее внимание исследователей [5–21]. Значитель-
ный интерес к SERS, кроме фундаментального научного интереса, связан с появле-
нием возможности создания высокочувствительных аналитических методик, а
также с развитием высокоселективных биосенсорных технологий с вовлечением в
исследования все новых высокоэффективных наноструктурированных материа-
лов разных металлов [21]. Для получения большого отклика системы важно, что-
бы агрегирующие металлические наночастицы образовывали дискретные класте-
ры. Для их образования используются различные красители, адсорбированные на
наночастицах, и к такому модифицированному кластеру присоединяются молеку-
лы ДНК.
Несмотря на отсутствие установившегося единого мнения о механизмах та-
кого усиления, полагается, что поверхностно-усиленное комбинационное рас-